Ngày 27/8, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an ra kết luận, đề nghị truy tố 15 bị can trong vụ án Xuyên Việt Oil về các tội Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí; Đưa hối lộ; Nhận hối lộ; Lợi dụng chức vụ, quyền hạn gây ảnh hưởng đối với người khác để trục lợi. Trong vụ án này, ông Trần Duy Đông, Phó Cục trưởng Cục Xúc tiến thương mại (cựu Vụ trưởng Vụ Thị trường trong nước thuộc Bộ Công Thương), bị cơ quan điều tra bắt tạm giam để điều tra, làm rõ về tội “Nhận hối lộ”.
Thông tin từ kết luận điều tra, từ tháng 8/2017 - 6/2023, ông Trần Duy Đông là Vụ trưởng Vụ Thị trường trong nước, có thẩm quyền chỉ đạo, quản lý chung mọi lĩnh vực công tác; lãnh đạo, quản lý, điều hành và chịu trách nhiệm trước pháp luật về việc quản lý, điều hành hoạt động của Vụ.
Giữa tháng 6/2021, ông Trần Duy Đông được Hoàng Anh Tuấn (khi đó là Phó Vụ trưởng Vụ Thị trường trong nước) báo cáo việc bà Mai Thị Hồng Hạnh (Chủ tịch kiêm Giám đốc Công ty Xuyên Việt Oil)) nhờ giúp đỡ cấp lại giấy phép kinh doanh xuất khẩu, nhập khẩu xăng dầu cho Công ty Xuyên Việt Oil.
Lúc này, ông Tuấn cũng nói về việc ông Đỗ Thắng Hải, cựu Thứ trưởng Bộ Công Thương có chỉ đạo nhanh chóng giải quyết hồ sơ xin cấp phép của doanh nghiệp này. Ngày 30/9/2021, ông Hoàng Anh Tuấn đưa ông Nguyễn Văn Thắng (cựu Phó Giám đốc Chi nhánh Hà Nội Công ty Xuyên Việt Oil) đến phòng làm việc của ông Đông tại Vụ Thị trường trong nước. Tại đây, ông Thắng đã đưa 250.000 USD của bà Hạnh để nhờ giúp đỡ việc cấp lại giấy phép cho Công ty Xuyên Việt Oil.
Sau khi ông Thắng ra về, tại phòng làm việc của mình, ông Trần Duy Đông và ông Hoàng Anh Tuấn đã chia số tiền hối lộ 250.000 USD (tương đương hơn 5,6 tỷ đồng) thành 2 phần. Trong đó, ông Trần Duy Đông giữ lại 120.000 USD (tương đương hơn 2,7 tỷ đồng), đưa cho ông Tuấn 130.000 USD (tương đương hơn 2,9 tỷ đồng).
Đến ngày 19/11/2021, trên cơ sở đề xuất của ông Hoàng Anh Tuấn, ông Đỗ Thắng Hải đã ký cấp giấy phép số 55, ngày 19/11/2021 cho Công ty Xuyên Việt Oil. Kết luận điều tra cho rằng, ông Trần Duy Đông đã nhận hối lộ tổng số tiền 250.000 USD của bà Mai Thị Hồng Hạnh. Nhưng số tiền mà ông Đông chiếm hưởng là 120.000 USD. Quá trình điều tra, ông Đông đã thành khẩn khai báo, ăn năn hối cải; tích cực hợp tác với CQĐT trong việc phát hiện, điều tra, làm rõ tội phạm. Ông Trần Duy Đông cũng đã tự nguyện nộp lại số tiền 120.000 USD để khắc phục hậu quả.
Theo kết luận điều tra, tháng 8/2023, Cơ quan An ninh điều tra nhận được đơn tố giác tội phạm của một nhân viên Công ty Xuyên Việt Oil, tố giác bà Hạnh đã sử dụng nhiều thủ đoạn gian dối để lừa đảo chiếm đoạt tài sản, sử dụng trái phép tài sản của cơ quan, tổ chức, Nhà nước và lạm dụng chức vụ, quyền hạn chiếm đoạt hơn 200 tỷ đồng tiền Quỹ bình ổn giá xăng dầu (Quỹ BOG) và hơn 1.200 tỷ đồng tiền Thuế bảo vệ môi trường.
Ngày 24/8/2023, Thủ trưởng Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã ra quyết định phân công giải quyết nguồn tin về tội phạm đối với đơn tố giác trên. Ngày 8/9/2023, Bộ Công an khởi tố vụ án hình sự, đồng thời khởi tố bị can, bắt tạm giam bà Mai Thị Hồng Hạnh và Nguyễn Thị Như Phương (Phó Giám đốc Công ty Xuyên Việt Oil) về tội Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí.
Quá trình điều tra, Cơ quan An ninh điều tra đã ra quyết định bổ sung quyết định khởi tố vụ án hình sự về các tội Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng; Đưa hối lộ; Nhận hối lộ; Lợi dụng chức vụ, quyền hạn gây ảnh hưởng đối với người khác để trục lợi.