Ngày 31/8, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an vừa có kết luận vụ án, đề nghị truy tố 38 bị can trong vụ án hình sự xảy ra tại Công ty Thành An Hà Nội, Công ty Thiết bị y tế Danh, Công ty Thiết bị y tế Tràng Thi và các đơn vị liên quan.
Trong số này, Nguyễn Đăng Thuyết (SN 1970, Giám đốc Công ty TNHH Thành An Hà Nội), Nguyễn Thị Hòa (SN 1978, cựu giám sát kế toán của công ty này, đang bỏ trốn), Bùi Thị Mai Hương (Kế toán trưởng Công ty Thiết bị y tế Danh) và 3 người khác bị đề nghị truy tố tội Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng. 32 người còn lại bị đề nghị truy tố về tội In, phát hành, mua bán trái phép hóa đơn, chứng từ thu nộp ngân sách Nhà nước.
Theo thông tin từ kết luận điều tra, trong giai đoạn 2017-2022, các bị can thuộc nhóm công ty trên lập 2 hệ thống sổ sách kế toán trên phần mềm, gồm hệ thống sổ kế toán tài chính nội bộ để ghi nhận toàn bộ số liệu thực thu, thực chỉ, kết quả kinh doanh thực tế.
Hệ thống thứ 2 là sổ kế toán tài chính thuế để khai man số liệu, lập các báo cáo tài chính, báo cáo thuế với các cơ quan quản lý Nhà nước, tăng chi phí đầu vào, tăng giá vốn hàng bán dẫn tới giảm lợi nhuận, giảm thuế phải nộp.
Cơ quan điều tra xác định, Nguyễn Đăng Thuyết là người chỉ đạo nhân viên kế toán tại Công ty Thành An trực tiếp quản lý 2 nhóm sổ sách này. Đỗ Thị Hoa (Kế toán trưởng của công ty) được giao kiểm soát toàn bộ hoạt động thu chi thực tế (được ghi nhận trên phần mềm sổ kế toán nội bộ) và số liệu kê khai thuế (số liệu không đúng) của cả 3 doanh nghiệp.
Bị can Nguyễn Thị Hòa bị cáo buộc lập kế hoạch dự tính số tiền thuế phải nộp trong năm. Song đây là số liệu không có thật, được ghi tăng chi phí đầu vào từ việc mua hóa đơn khống để giảm thuế phải nộp. Riêng Bùi Thị Mai Hương cùng Nguyễn Thị Hòa được Thuyết giao thêm nhiệm vụ quản lý chữ ký số (Token) để làm báo cáo thuế và xuất hóa đơn điện tử. Sau khi lập các báo cáo thuế, báo cáo tài chính trình, nhóm lãnh đạo doanh nghiệp sẽ duyệt và cấp dưới tự dùng chữ ký số để gửi cơ quan thuế.
Trong các năm từ 2017-2022, Thuyết và đồng phạm đã mua 19.167 hóa đơn khống (mặt hàng là danh mục vật tư y tế) của 110 công ty/hộ kinh doanh với tổng giá trị tiền hàng trước thuế là 3.689 tỷ đồng (thuế VAT là hơn 75 tỷ đồng). Trong đó, chi phí mua hóa đơn là 257 tỷ đồng.
Theo cơ quan điều tra, ở giai đoạn 2017-2022, tổng tài sản và tổng nguồn vốn là hơn 8.542 tỷ đồng; tổng lợi nhuận trước thuế 562 tỷ đồng; lợi nhuận sau thuế 448 tỷ đồng. Còn tổng số tiền thuế thu nhập doanh nghiệp nộp ngân sách là hơn 114 tỷ.
Tuy nhiên, tài liệu trích xuất từ hệ thống phần mềm nội bộ tại Công ty Thành An, Công ty Danh và Công ty Tràng Thi lại thể hiện, tổng tài sản và tổng nguồn vốn là hơn 12.828 tỷ đồng; tổng lợi nhuận trước thuế là 2.655 tỷ đồng; tổng lợi nhuận sau thuế là 2.563 tỷ đồng. Như vậy, sổ sách công khai và nội bộ có sự chênh lệch. Cụ thể, tổng tài sản và nguồn vốn tăng 4.286 tăng đồng; lợi nhuận trước thuế tăng 2.092 tỷ đồng.
Kết luận của giám định viên Cục thuế Hà Nội cho thấy, 3 công ty nêu trên đã sử dụng 19.167 hóa đơn khống để kê khai khấu trừ thuế giá trị gia tăng hàng hóa dịch vụ mua vào dẫn đến làm giảm tiền phải nộp, gây thiệt hại cho ngân sách hơn 62 tỷ đồng.
Về thuế thu nhập doanh nghiệp, việc 3 doanh nghiệp nói trên dùng hóa đơn khống, được mua từ các công ty và của các hộ kinh doanh để hạch toán kế toán khi làm báo cáo tài chính, xác định số thuế phải nộp đã làm giảm số tiền thuế là hơn 680 tỷ. Do vậy, điều tra xác định hành vi của các bị can gây thiệt hại tổng cộng hơn 743 tỷ đồng
Quá trình điều tra, các bị can đã nộp được hơn 93 tỷ đồng để khắc phục hậu quả vụ án. Cơ quan điều tra đã kê biên 18 bất động sản của các bị can, phong tỏa một số tài khoản với tổng số dư hơn 2,3 tỷ đồng.