Năm 2023, với mức 27,17 điểm, ngành Bác sỹ đa khoa đối với nữ là ngành có mức điểm chuẩn trúng tuyển cao nhất của Học viện Quân y.
Năm 2022, Học viện Quân y lấy điểm chuẩn cao nhất là ngành Bác sĩ đa khoa, lấy 28,3 điểm với đối tượng thí sinh nữ. Để xác định mức điểm này, nhà trường sử dụng 2 tiêu chí phụ: Tiêu chí phụ 1: Điểm môn Toán ≥ 8.8 điểm. Tiêu chí phụ 2: Điểm môn Hóa ≥ 9.75. Ngành Y học dự phòng có mức điểm thấp nhất là 23.55.
Năm 2021, Học viện Quân y lấy điểm chuẩn cao nhất là 28,5 điểm với đối tượng thí sinh nữ ngành Bác sĩ đa khoa. Để xác định mức điểm này, nhà trường sử dụng 2 tiêu chí phụ: Tiêu chí phụ 1: Điểm môn Toán ≥ 8.8 điểm. Tiêu chí phụ 2: Điểm môn Hóa ≥ 9.75 điểm. Ngành Y học dự phòng có mức điểm thấp nhất là 23.55 điểm.
Năm 2020, mức điểm chuẩn từ kết quả thi tốt nghiệp THPT đối với thí sinh nữ miền Bắc cao nhất là 28,65 điểm; đối với thí sinh nữ miền Nam là 28,3 điểm.
Điểm chuẩn từ kết quả thi tốt nghiệp THPT đối với thí sinh nam miền Bắc là 26,5 điểm; đối với thí sinh nam miền Nam là 25,5 điểm.
Điểm chuẩn Học viện Quân y theo phương thức xét tuyển học sinh giỏi bậc THPT với thi sinh nam miền Bắc là 23,35 điểm; điểm chuẩn Học viện Quân y theo phương thức xét tuyển học sinh giỏi bậc THPT với thí sinh nữ miền Bắc là 24,75 điểm.
Năm 2019, mức điểm chuẩn từ kết quả thi tốt nghiệp THPT đối với thí sinh nữ miền Bắc cao nhất 26,65 khối B00, đối với thí sinh nữ miền Nam là 25,35 điểm.
Điểm chuẩn từ kết quả thi tốt nghiệp THPT đối với thí sinh nam miền Bắc là 23,55 điểm (tổ hợp xét tuyển B00); đối với thí sinh nam miền Nam là 22,10 điểm.
Mức điểm chuẩn từ kết quả thi tốt nghiệp THPT đối với thí sinh nữ miền Bắc, tổ hợp xét tuyển A00 là 26,15 điểm, nữ miền Nam là 23,65 điểm.
Mức điểm chuẩn từ kết quả thi tốt nghiệp THPT đối với thí sinh nam miền Bắc, tổ hợp xét tuyển A00 là 25,25 điểm, nam miền Nam là 23,70 điểm.
Năm 2024, Học viện Quân y tuyển sinh tổng cộng 385 chỉ tiêu. Trong đó, Ngành Y khoa (Bác sĩ đa khoa) 335 chỉ tiêu, Dược học 40 chỉ tiêu và Y học dự phòng 10 chỉ tiêu.
Về phương thức xét tuyển 2024, Học viện Quân y sẽ xét tuyển thẳng, ưu tiên xét tuyển, tuyển học sinh giỏi (không quá 15% chỉ tiêu). Khoảng 85% chỉ tiêu còn lại, trường tuyển dựa hoàn toàn vào kết quả thi tốt nghiệp THPT.
Đối với thí sinh có kết quả học tập lớp 10, 11 và kỳ 1 lớp 12 đạt loại giỏi, hạnh kiểm tốt, kết hợp với một trong các điều kiện:
- Thí sinh đoạt giải nhất, nhì, ba cấp tỉnh, thành phố thuộc một các môn theo tổ hợp xét tuyển.
- Chứng chỉ tiếng Anh IELTS 5.5 hoặc TOEFL iBT 55 trở lên.
- Kết quả thi đánh giá năng lực SAT từ 1.068/1600 điểm trở lên.
- Kết quả thi đánh giá năng lực ACT từ 18/36 điểm trở lên.
Học viện Quân y tuyển sinh ngành Y khoa hệ quân sự bằng hai tổ hợp là A00 (Toán, Lý, Hóa) và B00 (Toán, Hóa, Sinh), cùng ngành Y học dự phòng quân sự bằng tổ hợp B00. Giống như năm trước, các thí sinh nguyện vọng vào trường phải đạt tiêu chuẩn về sức khỏe như: Nam cao 1,63m, nặng 50kg trở lên, nữ cao 1,54m, 48kg trở lên
Với các thí sinh mắc tật khúc xạ cận thị không quá 3 đi-ốp, kiểm tra thị lực qua kính đạt mắt phải 10/10, tổng thị lực hai mắt đạt 19/10. Tiêu chuẩn chiều cao, cân nặng sẽ thấp hơn đối với thí sinh ở khu vực 1 (hải đảo, dân tộc rất ít người).
Sẽ có khoảng 5% tổng chỉ tiêu tuyển sinh mỗi năm sau khi kết thúc năm học thứ nhất tại Học viện Quân y được tuyển chọn để gửi đi đào tạo đại học tại các quốc gia có nền y học phát triển, như: Nga, Cu Ba, Trung Quốc, Ấn Độ.