Giống các loại tàu bệnh viện khác, USNS Mercy không được trang bị vũ khí bởi theo luật pháp quốc tế, bắn vào tàu bệnh viện bị coi là tội ác chiến tranh.
[mecloud]KXEmtalWWX[/mecloud]
Tàu được bố trí 80 giường chăm sóc đặc biệt, 20 giường hồi sức cấp cứu. Khi hoạt động hết công suất, tàu có thể tiếp nhận và điều trị cho khoảng 1.000 bệnh nhân.
Ngoài ra, tàu còn có 12 phòng mổ với những trang thiết bị y tế hiện đại nhất, 1 phòng điều trị cách ly, 4 phòng chụp X-quang và 5.000 đơn vị máu. Tàu còn được trang bị một máy bay trực thăng vận tải MH-60 Sea Hawk.
Chi phí để vận hành tàu khoảng 40 triệu USD với nguồn ngân sách chủ yếu từ chính phủ và các tổ chức phi chính phủ.
Khi không hoạt động, USNS Mercy neo tại cảng San Diego với quân số từ 28-59 thành viên thủy thủ đoàn. Khi được yêu cầu, thủy thủ đoàn của tàu có thể lên tới 1.275 người, bao gồm cả chuyên viên dân sự, sĩ quan quân sự và tàu có thể hoạt động trong tình trạng đầy đủ trong 5 ngày.